The referenced script (Unknown) on this Behaviour is missing!

問題と解決法

[The referenced script (Unknown) on this Behaviour is missing!]の警告が出ているのに、ヒエラルキーをいくら探しても参照の切れたスクリプトは見つからなかった。

Prefabで参照が切れていたせいだった。
ProjectウィンドウからPrefabを開いて、openから空のスクリプトコンポーネントを除去したら治った。